Menyelenggarakan fungsi:

• Penyusunan kebijakan teknis pengawasan intern Inspektorat III; 
• Penyusunan rencana program pengawasan intern Inspektorat III;
• Pengawasan intern terhadap kinerja dan keuangan melalui audit, reviu, evaluasi, pemantauan, dan kegiatan pengawasan lainnya pada Direktorat Jenderal Perhubungan Laut;
• Pemantauan tindak lanjut hasil pengawasan intern pada Direktorat Jenderal Perhubungan Laut;
• Pengawasan penyelenggaraan sistem pengendalian intern, manajemen risiko, dan pelaksanaan fungsi kepatuhan internal pada Direktorat Jenderal Perhubungan Laut;
• Pelaporan hasil pengawasan;
• Koordinasi pelaksanaan reviu rencana kebutuhan Barang Milik Negara dan reviu kerja sama pemanfaatan Barang Milik Negara; dan
• Pelaksanaan urusan tata usaha Inspektorat III.